El aeropuerto castellanomanchego tiene una deuda con Aeropuertos Españoles y Navegación Aérea. Se ha llegado a un pacto y Aena está pendiente de cobrar.
La deuda asciende a 126 millones de euros a varios proveedores, entre ellos Aena. Esta información la publicó El Mundo y el aeropuerto la ha matizado. La deuda pendiente a Aena se debe a la prestación de los servicios de navegación aérea.