Desde la orden ministerial de diciembre de 2008, la que se modifica la estructura orgánica y el despliegue de las Fuerzas Armadas del Ejército de Tierra, del Ejército de Aire y de la Armada, se prevé la disolución de unidades a la BRIL V en el País Vasco. En concreto, se supre el Batallón del Cuartel General, el Batallón de Infantería de Carros de Vitoria (que se sustituye un regiento de infantería), el Grupo de Artillería de Campaña, el Batallón de Zapadores, el Grupo Logístico y la Compañía de Transmisiones.
Sin embargo el Gobierno ha asegurado que no se disminuirán ni efectivos ni piensa en cerrar ninguna base militar ni cuartel. De esta manera la Base de Araca en Vitoria no entra de los planes del Gobierno para su desafección y que sólo ha declarado sin interés militar dentro del País Vasco los terrenos e instalaciones donde se sitúa la Yeguada Militar de LoreToki en San Sebastián y Hernani y de la Real Sociedad Hípica Militar de Loyola en San Sebastián