Guenter Peter comenzó su carrera en las ventas de SmithKline en 1986 y se incoró al Grupo Sanofi en 1995 donde ha ocupado varios puestos en países europeos. En 2000 fue nombrado director general de Bélgica y vicepresidente para Europa del Este, Norte de Europa y Escandinavia. En 2008, fue nombrado Director General en Alemania, y desde 2011, ha sido director General para Alemania, Suiza y Austria.
Su nombramiento coincide con la marcha de Belen Garijo. Según ha informado la propia sanofi en un comunicado, Garijo se marcha de la compañía para ocupar un puesto de dirección internacional en otra compañía farmacéutica.